Karlık Mağarası’ndaki travertenlerin oluşumu, doğal süreçlerin karmaşık bir etkileşimiyle gerçekleşir. Bu süreç, yer altındaki su kaynaklarının mineral açısından zenginleşmesiyle başlar. Zamanla, bu zengin suyun yüzeye çıkması ve mağara içindeki ortamda birikmesi, travertenlerin şekillenmesine yol açar. Kalsiyum karbonatın tortulaşması ve zamanla sertleşmesi, bu etkileyici doğal oluşumların temelini oluşturur.

Kaklık Mağarası'ndaki travertenler, kalsiyum karbonat bakımından zengin kükürtlü ve yoğun karbonatlı jeotermal suların mağara içinde birikmesiyle oluşmuştur. Travertenlerin oluşum süreci:

1. Su Kaynağı: Faylar boyunca ilerleyen sular, yüzlerce metre derinlikten yüzeye çıkar.
2. Çökelme: Su, mağara içindeki traverten kayaçları üzerinde çökelir.
3. Sertleşme: Başlangıçta jel kıvamında olan tortular, zamanla sertleşerek travertenleri oluşturur.

Kaklık Mağarası'ndaki travertenlerin oluşumu, Pamukkale'deki travertenlerin oluşumuna benzerlik gösterir.