Afyonkarahisar, zengin termal kaynaklarıyla ünlü bir bölge olup, sağlık turizmi açısından önemli bir potansiyele sahiptir. Şehirde yer alan kaplıcalar, çeşitli sağlık sorunlarına şifa arayan ziyaretçilerin ilgisini çekmektedir. Sadece bilinen kaplıcalar değil, farklı yerlerde de keşfedilmeyi bekleyen kaplıcalar bulunmaktadır. Bu doğal kaynaklar, hem yerli hem de yabancı turistler için cazibe merkezi olma özelliği taşımaktadır.

Afyonkarahisar'da bulunan bazı kaplıcalar şunlardır:

• Ömer-Gecek Kaplıcası. Şehir merkezine 6 km uzaklıkta olup, kalp-damar hastalıkları, sinirsel rahatsızlıklar ve eklem hastalıkları için iyileştirici özelliklere sahiptir.
• Gazlıgöl Kaplıcaları. Afyon merkezine 20 km uzaklıkta, romatizma, deri hastalıkları, kadın hastalıkları ve metabolizma bozukluklarına iyi gelir.
• Sandıklı Hüdai Kaplıcaları. Romatizmal hastalıklar, cilt hastalıkları ve diğer sağlık sorunları için tedavi seçenekleri sunar.
• Heybeli Kaplıcası. Özellikle romatizmal hastalıkların tedavisinde kullanılır, aynı zamanda deri hastalıklarına ve uyuza iyi geldiği bilinir.

Bunların dışında, Afyonkarahisar'da İhsaniye, Hüdai, Başmakçı gibi bölgelerde de kaplıcalar bulunmaktadır.